In den Arbeitskreisen Mikrobiologie und Chemie werden aktuelle Probleme der milchwirtschaftlichen Untersuchungspraxis behandelt sowie neue Verfahren und Methoden auf Anwendbarkeit überprüft. In unterschiedlichen Zeitabständen führen die in der Fachgruppe zusammenarbeitenden Anstalten Ringuntersuchungen an Milch und Milchprodukten durch, um eine einheitliche Ausrichtung der Methoden bei der Anwendung zu erreichen. Außerdem wird hierdurch gewährleistet, dass die bestehenden Methoden auf dem aktuellen Stand gehalten, bzw. neue auf ihre sichere Anwendung überprüft werden (Methodenbuch VI „Chemische, physikalische und mikrobiologische Untersuchungsverfahren für Milch, Milchprodukte und Molkereihilfsstoffe“).